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虹鳟鱼的遗传研究人员序列基因组
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- 2025-03-27 11:09:31
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法国国家农业研究所的Yann Guiguen博士领导的科学家已经成功地对虹鳟Oncorhynchus mykiss的基因组进行了测序。
虹鳟鱼是一种细长的鱼,其侧面从背鳍下方的绿色逐渐褪色成黄色和白色,属于鲑鱼科,这是一种鱼类,其中还包括鲑鱼,鲑鱼和河鳟。
这种鱼类跨越了自然和养育的世界,在一定的温度和水质范围内自然生长,同时对驯养的反应也是如此,以至于人们亲手将其从环太平洋传播到六大洲的水域。
在他们的研究中,Guiguanen博士和他的同事们专注于自大约1亿年前虹鳟发生罕见的基因组倍增事件以来基因进化的速率。
与大多数涉及突变和有利性状选择的进化过程不同,加倍事件的行为就像是写作的抄本,可以被编辑和重铸而不会破坏早期版本。
通常,这种倍增事件的后果在后代中被选择性力量驱逐出科学界。但是,从进化论上来说,因为1亿年是相对较短的时间,鳟鱼研究人员实际上可以瞥见鱼的进化编辑过程。
“在人类和大多数脊椎动物中,重复事件的发生时间较长,因此仍然存在较少的重复基因。大多数重复的基因丢失或修饰得如此之多,以至于随着时间的推移它们不再被识别为重复的。在鳟鱼和鲑鱼中,我们可以看到该过程的早期阶段,并且仍然存在许多重复的基因。”华盛顿州立大学的加里·索加德博士说,他是该论文的合著者,该论文发表在《自然通讯》上。
研究小组使用了虹鳟鱼的基因组序列和基因表达数据,表明自从其遗传倍增事件以来,所有蛋白质编码基因中大约有一半已被删除。
它保留了几乎所有的microRNA基因,有助于调节基因表达。
科学家还发现,这些鱼保留了与胚胎发育以及神经细胞之间的连接发育有关的原始或近乎原始的基因。
与这些变化有关的时机表明,诸如此类的事件发生后的基因进化比以前认为的要慢得多。
索尔加德博士说:“在不同情况下,进化的速度似乎会有所不同。”
“有些动物,例如肺鱼和腔棘鱼,都是'活化石',已经存在了数亿年,而并没有太大变化。其他人,如北极熊,似乎是最近才进化的。鳟鱼基因复制后,该过程比大多数其他脊椎动物更缓慢地进行,我们仍然可以看到它的进行。”